罗丹明染料是荧光素的补充剂，因为它们提供更长波长的发射*大值，并为多色标记和染色提供了机会。 罗丹明的光稳定性高于荧光素和香豆素。 羧基四甲基罗丹明（TAMRA）是用于制备寡核苷酸缀合物的常见荧光团。 磺酰罗丹明101磺胺氯化物（TexasRed®）是另一种流行的寡核苷酸标记染料。 然而，TexasRed®不稳定，与其他羧基罗丹明染料（如5-TAMRA，SE）相比，其偶联产率低得多。
AAT Bioquest研发了California Red™取代了TexasRed®。 California Red™具有与TexasRed®几乎相同的光谱特性和类似的水溶性。 California Red™更稳定，并且比TexasRed®具有更高的共轭产率。
图1.用于标记寡核苷酸的典型罗丹明染料的化学结构
表2.用于标记寡核苷酸的罗丹明染料
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货号
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产品名称
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规格
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Ex (nm)
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Em (nm)
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EC (cm-1 M-1)
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CF @260 nm
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价格
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479
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核酸多肽蛋白标记 California Red SE
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1 mg
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583
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603
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100,000
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0.456
|
1140
|
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473
|
核酸多肽蛋白标记 California Red SE
|
5mg
|
583
|
603
|
100,000
|
0.456
|
1740
|
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470
|
丽丝胺碱性蕊香红B磺酰氯 CAS 62796-29-6
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100 mg
|
568
|
583
|
85,000
|
0.288
|
1140
|
|
380
|
5(6)-ROX 5(6)-羧基-X-罗丹明 CAS 198978-94-8
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100 mg
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568
|
591
|
85,000
|
0.301
|
5940
|
|
390
|
5(6)-ROX, SE 5(6)-羧基-X-罗丹明琥珀酰亚胺酯
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25 mg
|
576
|
601
|
93,000
|
0.301
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2340
|
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495
|
6-ROX 6-羧基-X-罗丹明炔烃
|
5 mg
|
575
|
602
|
95,000
|
0.307
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1740
|
|
494
|
6-ROX 6-羧基-X-罗丹明叠氮化物
|
5 mg
|
575
|
602
|
95,000
|
0.307
|
1740
|
|
426
|
6-ROX 6-羧基-C2-罗丹明马来酰亚胺
|
1 mg
|
575
|
602
|
95,000
|
0.307
|
1140
|
|
392
|
6-ROX, SE 6-羧基-X-罗丹明琥珀酰亚胺酯 CAS 216699-36-4
|
5 mg
|
575
|
602
|
95,000
|
0.307
|
1140
|
|
480
|
磺基罗丹明101磺酰氯
|
10 mg
|
588
|
601
|
100,000
|
0.456
|
1140
|
|
370
|
5(6)-TAMRA, SE 5(6)-羧基四甲基罗丹明琥珀酰亚胺酯 CAS 246256-50-8
|
25 mg
|
546
|
575
|
75,000
|
0.320
|
1140
|
|
423
|
5(6)-TAMRA C6 马来酰亚胺
|
5 mg
|
544
|
575
|
75,000
|
0.320
|
1140
|
|
491
|
6-TAMRA 6-羧基四甲基罗丹明炔烃
|
5 mg
|
547
|
573
|
75,000
|
0.335
|
1740
|
|
490
|
6-TAMRA 6-羧基四甲基罗丹明叠氮化物
|
5 mg
|
547
|
573
|
75,000
|
0.335
|
1740
|
|
425
|
6-TAMRA 6羧基四甲基罗丹明-C6-马来酰亚胺
|
5 mg
|
544
|
575
|
75,000
|
0.335
|
2340
|
|
357
|
6-羧基四甲基罗丹明尸胺 6-TAMRA cadaverine
|
5 mg
|
544
|
575
|
75,000
|
0.335
|
3540
|
|
6051
|
6-TAMRA 6-羧基四甲基罗丹明 CPG*1000 Å*
|
1 g
|
546
|
578
|
75,000
|
0.335
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5940
|
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359
|
6-羧基四甲基罗丹明乙二胺 6-TAMRA ethylenediamine
|
5 mg
|
544
|
575
|
75,000
|
0.335
|
2340
|
|
419
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6-TAMRA 6羧基四甲基罗丹明马来酰亚胺 CAS 174568-68-4
|
1 mg
|
540
|
567
|
75,000
|
0.335
|
2340
|
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376
|
6-TAMRA, SE 6-羧基四甲基罗丹明琥珀酰亚胺酯 CAS 150810-69-8
|
5 mg
|
547
|
573
|
78,000
|
0.335
|
1188
|
|
485
|
Texas Red 炔烃
|
5 mg
|
588
|
601
|
95,000
|
0.456
|
1740
|
|
484
|
Texas Red 叠氮化物
|
5 mg
|
588
|
601
|
95,000
|
0.456
|
1740
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